Просклонять слово КАЛЬЦИЙ: потребность организма в кальциЕ? Меня убеждают, что в КАЛЬЦИИ.

Тебя правильно убеждают:

в кальцИИ

И.п. Кальций.
Р.п. Кальция
Д.п. Кальцию
В.п. Кальций
Тв.п Кальцием
Пр.п. О кальции 

Действительно, потребность организма в кальции, так же как и в магнии.