какие признаки позволяют характеризовать отдельные религиозные организации как экстремисткие?

Признаки экстремистких религиозных организаций - тоталитаризм и возвышение определенных ценностей, например, определенные идеи в какой-то религиозной конфессии. 
А также признаки можно выделить по формам. Это деформирует конфессию изнутри посредством выше указанных идей, устраняет другие конфессии, деструктивно воздействует на личность, обязательно преобразует этнос (если этнорелиогный экстремизм), а также нацелен изменить политическую систему, конечно, в угоду восхваляемым идеям.