почему с помощью микроскопа нельзя изучать непрозрачные предметы

Потому что через непрозрачный предмет свет не проходит.

Главный принцип работы светового микроскопа состоит в том, что через прозрачный или полупрозрачный предмет (объект исследования), размещенный на предметном столике, проходят лучи света и попадают на систему линз объектива, которые увеличивают изображение. Эту же роль играют линзы окуляра, через которые исследователь изучает объект.
А через непрозрачные предметы свет не проходит , соответственно, изображения мы не увидим.

спс