Отличие между обычными и половыми хромосомами ?

Обычных 46(диплоидный набор), половых 23(гаплоидный набор), но это у человека, если говорить в общем, то можно ответить, что в "гаплоидности и диплоидности", а функция у них та же - передача и хранение наследственной информации. 

Ну и еще половые хромосомы отвечают за определение пола особи, а обычные - нет.