С помощью какой программы можно создать .jar файл и .apk файл?

JAR - формат исполняемых сборок для виртуальной машины Java - JVM.

Для "создания" файла .jar необходимо иметь на компьютере как минимум соответсвующий компилятор javac. А ещё лучше поставить JDK (Java Development Kit) целиком и спокойно заниматься разработкой.

APK - формат исполняемых файлов для операционных систем Android. Для компиляции и декомпиляции файлов .apk можно использовать APKTool.

Однако если целью ставится полноценная разработка под Android настоятельно рекомендуется установить Android Studio, в котором уже имеется настроенная "из коробки" среда сборки готовых APK-сборок.